Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pdcl3Q8BVF2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pdcl3Q8BVF2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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