Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg4bQ8BGE6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms