Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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