Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms