Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GcsamQ6RFH4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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