Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms