Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rcbtb1Q6NXM2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rcbtb1Q6NXM2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms