Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms