Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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Jmjd1cQ69ZK6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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