Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf2Q64705 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms