Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Ccdc18Q640L5 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Ccdc18Q640L5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Ccdc18Q640L5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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