Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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PcolceQ61398 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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