Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms