Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf3Q60765 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms