Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms