Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sin3aQ60520 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.2 ms