Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms