Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms