Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ecm2Q5FW85 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.9 ms