Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms