Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rtl6Q505G4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rtl6Q505G4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rtl6Q505G4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rtl6Q505G4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rtl6Q505G4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rtl6Q505G4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rtl6Q505G4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rtl6Q505G4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rtl6Q505G4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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