Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pdp2Q504M2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pdp2Q504M2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pdp2Q504M2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pdp2Q504M2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pdp2Q504M2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pdp2Q504M2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pdp2Q504M2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Pdp2Q504M2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Pdp2Q504M2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdp2Q504M2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Pdp2Q504M2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms