Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ttc9Q3V038 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9Q3V038 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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