Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms