Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms