Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms