Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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