Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

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Length 891 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fam35aQ3UEN2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Fam35aQ3UEN2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Fam35aQ3UEN2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Fam35aQ3UEN2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Fam35aQ3UEN2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam35aQ3UEN2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms