Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trafd1Q3UDK1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms