Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf180Q3U827 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms