Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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