Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms