Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms