Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hace1Q3U0D9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms