Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trappc13Q3TIR1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms