Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ttc39dQ0VF76 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ttc39dQ0VF76 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ttc39dQ0VF76 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms