Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

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Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atp2b3Q0VF55 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms