Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms