Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms