Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EgfrQ01279 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms