Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms