Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pou1f1Q00286 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pou1f1Q00286 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pou1f1Q00286 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pou1f1Q00286 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pou1f1Q00286 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pou1f1Q00286 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pou1f1Q00286 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pou1f1Q00286 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou1f1Q00286 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pou1f1Q00286 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Pou1f1Q00286 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou1f1Q00286 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Pou1f1Q00286 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Pou1f1Q00286 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms