Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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