Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcc1P97496 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms