Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms