Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pkn1P70268 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pkn1P70268 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms