Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sumo1P63166 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms