Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfybP63139 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NfybP63139 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NfybP63139 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms