Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Epb41l4aP52963 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Epb41l4aP52963 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Epb41l4aP52963 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Epb41l4aP52963 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb41l4aP52963 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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