Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Lbx1P52955 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lbx1P52955 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms